정계정맥류의 발생은 여러가지가 있지만 주된 원인은 정맥 내 판막의 해부학적인 이상과 정맥의 유출 경로가 관계되어 있습니다. 정계정맥류는 한쪽 혹은 양측의 고환에 동시에 나타날 수 있지만 85%이상이 좌측에 흔히 발생합니다.

우측에 있는 내정계정맥의 경우는 비스듬히 하대정맥으로 들어가지만, 좌측에 있는 내정계정맥은 직각으로 신장 정맥이 이어지므로 우측보다 중력에 대한 저항이 크게 되어 하방으로(고환 쪽으로) 혈액이 역류되는 힘이 더 커집니다.